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En date du 4 Mars 2023, le Président de la République Française, Emmanuel Macron a visité l'Institut National de Recherche Biomédicale, fleuron de la coopération Franco-Zaïroise à l'époque, qui a été inauguré en 1984 par le Président François Mitterand et le citoyen Kengo Wa Dondo.

Le gouvernement de la République Démocratique du Congo adhère à l'initiative Prezode "Preventing Zoonotic Disease Emergence", lancée en 2021 par le Président de la France, Emmanuel Macron pour lutter contre les maladies zoonotiques émergentes et réemergentes.

Grâce à la feuille de route Franco-Congolaise en matière de santé signée en 2019, la République Démocratique du Congo a bénéficié du soutient de la France au travers de l'Institut National de Recherche Biomédicale dans le financement du laboratoire de séquençage et dans la lutte contre la Covid-19.

Pendant cette même visite, la convention Prisme "Plate forme de recherche internationale sur la santé mondiale" a été signée. Ladite convention constitue le retour d'un nouveau partenariat scientifique entre la France et la RDC au travers d'un réseau entre l'Institut National de Recherche Biomédicale (RDC), l'Université de Kinshasa (RDC), l'Institut de recherche pour le développement (France), l'Université de Montpellier (France), l'Agence nationale de recherches sur le sida et les hépatites virales (France), l'Institut national de la santé et de la recherche médicale (France), et l'Ambassade de la France en République Démocratique du Congo.

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Le laboratoire de Génomique des Pathogènes de l'Institut National de Recherche Biomédicale, a accueilli 2 membres (une Médecin Biologiste et un Technicien de laboratoire) de l'équipe du laboratoire d'investigation de Baney en Guinée équatoriale pour une formation de 15 jours, du 13 Février au 1^er Mars 2023 sur la surveillance génomique du SARS-CoV-2 et l'initiation à la bio-informatique. Cette formation est soutenue par l'OMS AFRO - EPR Hub de Dakar.

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Une équipe du Laboratoire de Génomique des Pathogènes de l’Institut National de Recherche Biomédicale a effectué une mission à Kampala (Ouganda) du 5 Au 9 Décembre 2022 pour renforcer les capacités des techniciens de laboratoire et bio-informaticiens du Central of Public Health Laboratories (CPHL) sur le séquençage du génome complet du virus Ebola Soudan à l’aide de la plateforme Nanopore. Cette formation a été financée par Africa CDC-Pathogen Genomics Initiative (PGI) et African Society for Laboratory Medicine (ASLM).

Les fièvres hémorragiques virales constituent une menace pour la santé publique dans le monde entier, elles comprennent un certain nombre de maladies graves, et pouvant être mortelles, causées par des virus tels que Ebola et autres. 

Depuis le 20 septembre 2022, l’Ouganda a déclaré une épidémie d’Ebola après la confirmation d’un cas d’Ebola virus dans la partie centrale du pays. Fin Novembre, le pays avait confirmé 142 cas, dont 86 guéris et 56 morts, soit un taux de létalité d’environ 40 %. Alors que le pays s’efforce de maîtriser totalement l’épidémie, la surveillance génomique fait partie des interventions prévues pour soutenir et suivre l’évolution du virus, identifier les chaînes de transmission et rechercher l’origine de l’épidémie.

C’est dans ce cadre que le Central of Public Health Laboratories (CPHL), avec le soutien de Africa CDC au travers de Pathogen Genomics Initiative (PGI), a demandé l’appui technique de l’Institut National de Recherche Biomédicale (INRB) par le biais de son Laboratoire de Génomique des Pathogènes (LGP) afin de renforcer la capacité génomique du personnel du CPHL à séquencer le virus Ebola du Soudan et à soutenir les activités de réponse à l’épidémie en Ouganda. 

Le Laboratoire de Génomique des Pathogènes effectue une surveillance génomique des agents pathogènes émergents et réémergents ayant un fort impact sur la santé publique. Ce laboratoire joue un rôle central dans la réponse à diverses urgences de santé publique en République Démocratique du Congo et dans la région d’Afrique centrale ainsi que dans d’autres pays africains.

La formation a duré 5 jours et a consisté à former des techniciens de laboratoire à l’application en laboratoire humide des techniques de génomique pour séquencer le virus Ebola sur les plateformes disponibles dans le pays, former les bio-informaticiens de laboratoire à l’analyse, à l’interprétation et au partage des données de séquençage, l’interprétation et le partage des données de séquençage et enfin faire une démonstration de la mise en place d’un laboratoire mobile de séquençage mobile sur le terrain. 

La plateforme Oxford Nanopore Technology (ONT) a été sélectionnée pour les activités de séquençage dans le cadre de ce soutien technique à l’équipe du Central Public Health Laboratories (CPHL).  

Par ailleurs,   les activités de séquençage ont été également faites avec la plateforme Illumina pour permettre non seulement de comparer les résultats obtenus mais aussi d’offrir  à l’équipe locale la possibilité d’utiliser les deux plateformes (Nanopore et Illumina) pour le séquençage d’Ebola comme pour d’autres pathogènes pour lesquels le CPHL concentre ses efforts. Pour les échantillons séquencés sur ONT, le protocole GunIT a été utilisé avec les amorces SUDV-1000 et le DNA Prep. les mêmes échantillons ont été utilisés pour les deux plateformes. 

Les analyses bio-informatiques pour la plateforme ONT ont été réalisées avec le pipeline artic-wrapper et Ivar pour la plateforme Illumina. Au total, 39 des 58 échantillons séquencés avec la plateforme Nanopore avaient une couverture supérieure à 80%. Ces résultats ont conduit à conclure que les   équipes avaient détecté le génome complet d’Ebola Soudan.

Après 4 jours de formation au laboratoire, l’équipe de Laboratoire de Génomique des Pathogènes de Kinshasa, celle du Central of Public Health Laboratories (CPHL) d’Ouganda et celle de Africa CDC ont effectué une descente à 148,8 kilomètres de Kampala, à l’hôpital régional de référence de Mubende (MRRH) qui est l’unité de traitement d’Ebola (ETU) afin de tester le déploiement du laboratoire mobile apporté depuis Kinshasa en République Démocratique du Congo avec quelques consommables par l’équipe de l’INRB. Cet exercice a permis au laboratoire local de se faire une idée sur l’importance des activités de séquençage au terrain et comment procéder au déploiement. 

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Sous la supervision du Professeur Placide Mbala, chef du Département d’Epidémiologie à l’INRB, un groupe des jeunes chercheurs Congolais participent depuis le mois de mai à une formation sur les maladies émergentes et réémergentes. D’autres membres de ce département effectuent actuellement plusieurs travaux de recherche en rapport avec la vaccination, la surveillance environnementale et la surveillance de la dynamique des anticorps de la Covid-19.

Un groupe de jeunes chercheurs congolais, membres du Département d’Epidémiologie de l’Institut National de Recherche Biomédicale (INRB), est en cours de formation sur les maladies émergentes et réémergentes à Kimpese et à Lubumbashi dans le cadre du partenariat entre l’INRB et l’Institut de Médecine Tropicale d’Anvers (IMT). 

Trois de ces chercheurs dont un biostatisticien, un data manager et un coordonnateur d’études ont bénéficié d’une bourse de l’IMT Anvers et séjournent actuellement en Belgique où ils sont en formation d’une année au centre de recherche clinique de l’IMT Anvers.

D’autres membres de ce département réalisent des travaux de recherche sur la surveillance de la dynamique des anticorps de la Covid-19 chez les prestataires de soins et les membres de leurs familles dans la ville province de Kinshasa.

Les sites choisis pour réaliser le 5^ème round de cette étude sont les zones de santé de Limete, Lemba, Lingwala, Ndjili et Bandalungwa. Selon le Professeur Placide Mbala, chef du Département d’Epidémiologie à l’INRB, la prévalence chez les prestataires lors de précédents rounds varie entre 15 à 18%; les recherches sont en cours pour les membres de leurs ménages.

L’étude de Surveillance des eaux usées dans les hôpitaux qui ont pris en charge les personnes affectées par la covid-19 se poursuit dans la ville province de Kinshasa. La partie prospective de cette recherche a eu lieu dans les sites des hôpitaux des Cliniques Universitaires, Clinique Ngaliema et à l’Hôpital du Cinquantenaire du Congo.  

D’autre part, deux nouvelles études ont été mis en place, il s’agit d’une étude sur la Surveillance génomique du SARS CoV-2 avec comme objectif de suivre la distribution de différents variants de SARS CoV-2 chez les personnes atteintes de la Covid-19 en République Démocratique du Congo et d’une autre étude  appelée FIVAC pour évaluer les facteurs qui influencent la vaccination de routine et la vaccination contre les épidémies à Kinshasa, au Kongo Central, dans le kwilu et le kwango. Cette recherche a pour but de comparer ces facteurs dans deux provinces fortement et faiblement touchées par la pandémie à coronavirus en RDC.  Le Département d’épidémiologie est en attente des autorisations nécessaires pour les travaux de terrain.